國內外治理畜禽糞便的方法主要分為產前、產中和產后治理。產前制定相關政策，規劃布局，優化畜牧場設計方案、飼料科學配方，加入添加劑控制畜禽氮、磷、鉀的排放量，減少豬糞發酵中氨與硫化氫的揮發，減輕氮素損失與豬糞的惡臭；

產中強化管理，建立畜禽業污染信息系統，控制畜禽飼養環境，防治畜禽糞尿及沖洗水流失；產后對畜禽糞尿進行資源化、無害化處理。目前更多的是對各種畜禽糞尿進行產后處理。

產生原因：在早期的傳統畜牧業生產中以農家個體飼養為主，農家個體畜禽養殖頭數不多，其產生的糞尿相對較少，到了上世紀80年代中期，一方面由于我國自然資源的約束，畜產品生產的發展只能通過資源的強化使用來實現，畜牧業生產出現集約化、集中化的趨勢；

一些地方將規?；笄蒺B殖作為產業結構調整、增加農民收入的重要途徑加以鼓勵，部分大城市和城郊出現了一批集約化或工廠化畜牧場。畜禽養殖規模越來越大，生產集約化程度越來越高，并與種植業日益脫節，產生的畜禽糞污在一定的時空范圍內沒有足夠的土地消納，出現處理的問題。